建档立卡户本子丢失后可补办，具体分以下情况处理：1.若本子仅单纯遗失，无损坏或被冒用风险，按常规流程向原发证机关申请补办即可，关键是准备好能证明建档立卡户身份的材料。2.若存在被冒用风险，除申请补办外，需及时向当地相关部门（如扶贫办、派出所）说明情况，避免权益受损，此时除身份证明外，可能还需提供情况说明或报警记录。3.若因自然灾害、意外事故等不可抗力导致丢失，申请补办时可向相关部门说明情况，部分地区会简化流程或提供协助。

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